Autor o autores

Collado MD, Hernández P, Sainz J, Ferrer MA, García A, Salvatierra J, Blanco A, López J, Ramírez C, Guzmán M y Cáliz R

E-Mail de Contacto

soanre@soanre.es

Centro

Hospital Virgen de las Nieves. Granada

Tema

Publicacion

Objetivos

La artritis reumatoide (AR) se caracteriza por inflamación crónica y
destrucción de hueso y cartílago en articulaciones. El perfil de expresión
génica se ha utilizado para caracterizar y/o clasificar mejor diferentes
enfermedades entre ellas AR y para comprender las rutas moleculares
implicadas en la patogénesis de la enfermedad. El propósito de este trabajo
es encontrar genes candidatos que puedan estar implicados en la patología
de la AR a trvés de estudios de expresión génica con microarrays

Pacientes y Metodo

Se ha utilizado ARN total obtenido a partir de sangre periférica con tubos
Paxgene (Preanalytrix) y el kit RNAeasy (QUIAGEN) de dos grupos con tres
individuos por cada en duplicado: Controles sanos y Pacientes con AR
desarrollada (> de 5 años) que cumplian los criterios de diagnóstico de la
ACR. La calidad del ARN total se ánalizó por electroforesis capilar (Agilent
2100). Los microarrays que se utilizaron fueron CodeLInk de genoma
humano completo (unos 57000 genes). Los datos de fluorescencia se
obtuvieron con el escaner GenePix 4000B con el software GenePixPro v 4.1 y
analizados con CodeLink Expression Analysis v 4.0. La normalización se
realizó por «Contrast Based Method». Los genes significativamente
expresados se seleccionaron a través de SAM (Significative Analysis of
Microarray) ajustando el FDR (False Discovery Rate). Posteriormente el
cluster posibilistico de estos genes se realizó de acuerdo a su similaridad GO
(Gene Ontology).

Resultados

Inicialmente se han examinado los genes relacionados con autoinmunidad y
respuesta inflamatoria (unos 350 genes). Se han encontrado unos 50 genes
diferencialmente expresados (sobre y sub-expresados) en pacientes con AR.
Estos genes se pueden clasificar en grupos diferentes de acuerdo a criterios
funcionales de GO. 1.- Quemoquinas, citoquinas y sus receptores: CCL18,
CXCR4, IL1R1, IL4R, IL10RB, LTB4R, IL18, TGFBI, TNF, TNFRSF7, VGF. 2.-
Proteínas de transducción de señal: CALM1, EVI1, GSK3B, IKBKE, JAK1,
MAPK14, VAV1. 3.- Factores de transcripción: FOSL2, MYC, NFAT5, NFKBIA,
NFRKB, RUNX2, STAT4. 4.- Otros genes relacionados con la respuesta
inmune: FCGR3A, TLR2, TLR3, BCL2, ICAM3, NCAM1, PIN1, SELL.

Conclusiones

Este acercamiento a través de criterios funcionales de agrupamiento de GO es muy útil para relacionar activación del receptor y rutas de transducción de
señal con proteínas adaptodaras, proteinas quinasas, y factores de
transcripción nucleares de las rutas de la respuesta inmune. estos datos
sugieren que algunas de estas rutas de respuesta inmune están alteradas y
pueden estar implicados en la patología de la AR